Sungai ini mengalir di wilayah barat pulau Papua yang beriklim hutan hujan tropis (kode: Af menurut klasifikasi iklim Köppen-Geiger).[4] Suhu rata-rata setahun sekitar 24°C. Bulan terpanas adalah Januari, dengan suhu rata-rata 26°C, and terdingin Februari, sekitar 22°C.[5] Curah hujan rata-rata tahunan adalah 3744mm. Bulan dengan curah hujan tertinggi adalah Juni, dengan rata-rata 484mm, dan yang terendah Oktober, rata-rata 153mm.[6]
DAS Wariagar (Aimau) di mana sungai utamanya bermuara di wilayah perairan Teluk Bintuni