Subunit delta/epsilon ATP sintase adalah bagian dari ATP sintase dan keluarga F-ATPase secara umum. Subunit ini dikenal sebagai subunit delta pada ATP sintase mitokondria, dan subunit epsilon pada ATP sintase bakteri dan kloroplas. Subunit ini merupakan bagian dari rotor di antara subunit F1 dan FO.[1] Domain C terminal-nya tampak menghambat aktivitas ATPase dari sintase tersebut.[2]