Stasiun Rebun dibuka pada tanggal 10 Desember 1923. Dengan privatisasi Kereta Api Nasional Jepang (JNR) pada 1 April 1987, stasiun ini berada di bawah kendali JR Hokkaido.
Rencana
Pada bulan Juni 2023, stasiun ini terpilih menjadi salah satu dari 42 stasiun di jalur JR Hokkaido yang dijadwalkan akan dihapus karena rendahnya jumlah penumpang.[1]
↑Sugiyama, Junichi (26 June 2023). "「JR北海道が42駅廃止検討」報道、宗谷本線の駅がごっそり消える?"[Report of JR Hokkaido regarding abolition of 42 Stations, majority of which are on the Soya Main Line]. MyNavi Corporation (dalam bahasa Jepang). Diarsipkan dari versi aslinya tanggal 27 June 2023. Diakses tanggal 4 July 2023.
