Separi adalah salah satu desa di Kecamatan Tenggarong Seberang, Kabupaten Kutai Kartanegara, Provinsi Kalimantan Timur, Indonesia, yang terletak di tepi sungai Mahakam. Desa Separi terbagi dalam 20 Rukun Tetangga (RT) dan 3 Dusun yakni Dusun Segunam, Dusun Sungai Entapi dan Dusun Sungai Separi.