Awalnya, Sana Daja merupakan satu kesatuan dengan 2 desa lainnya yaitu Desa Sana Tengah dan Sana Laok yang dipompin seorang kepala desa yaitu Pujuk Somi yang ditunjuk langsung oleh Raden Ronggosukowati. Awalnya, Desa ini bernama Desa Sanah yang wilayahnya meliputi Desa Sana Laok, Sana Tengah dan Sana Dajah. Pemekaran atau pembagian wilayah Sana menjadi tiga desa ini dilakukan oleh Pujuk Somi menjelang wafatnya beliau. Yang menurut legenda pinutur masyarakat, Pujuk Somi merasa bahwa pemimpin desa setelahnya tidak akan mampu mengontrol desa seluas itu.
