SMA Negeri 6 Jakarta didirikan pada 1 Agustus1952 dengan nama SMA Negeri II ABC. Kemudian berganti nama pada tahun ajaran 1954/1955, menjadi SMA Negeri VI ABC. Seiring dengan perubahan sistem pendidikan, maka pada tahun ajaran 1964/1965 SMA Negeri VI ABC berganti nama dengan SMA Negeri 6 Jakarta. Pada saat cikal bakal SMA Negeri 6 Jakarta didirikan, sekolah ini berlokasi di Jalan Bulungan. Kemudian dari 1 Januari1969 sampai sekarang, SMA Negeri 6 Jakarta menempati gedung baru yang berlokasi di Jalan Mahakam I, Kebayoran Baru, Jakarta Selatan.
Mottto utama SMA 6 Jakarta adalah "Together We Build, Together We Can", yang berarti "Bersama kita membangun, bersama kita pasti bisa". Motto ini bermakna adanya rasa persaudaraan dan kerjasama yang tinggi di antara seluruh warga SMA Negeri 6 Jakarta demi membangun / meningkatkan segala sesuatu yang berkaitan dengan pendidikan dan akademis di sekolah itu. Motto utama ini terpampang di gedung sebelah utara. Motto lainnya adalah "School Of Champions". Motto ini berarti "Sekolah Sang Juara" dan terpampang di gedung bagian timur SMA Negeri 6 Jakarta.
Glopreus merupakan ajang lomba Paskibra yang tak asing lagi bagi paskibra di kawasan Jabodetabek (Jakarta, Bogor, Depok, Tangerang dan Bekasi). Sebuah Event kebanggaan Paskibra Mahakam SMA Negeri 6 Jakarta. Merupakan lomba Paskibra yang selalu menampilkan sensasi tersendiri dalam pelaksanaannya baik bagi peserta maupun suporter dan penonton yang menghadiri kegiatan ini, sehingga event ini telah menjadi kegiatan Favorit khususnya bagi aktivis paskibra sekolah.
Mahakam Cup (Mahcup)
Kegiatan yang sering diadakan tiap tahun oleh SMA Negeri 6 Jakarta dengan mengundang berbagai sekolah dari tingkat SMA & SMK untuk mengikuti lomba dalam berbagai bidang olahraga untuk menjunjung tinggi sportivitas dan kekompakan tiap tim sekolah yang diundang untuk memperebutkan hadiah dan piala bergilir dari SMA Negeri 6 Jakarta. Diadakan terakhir kali pada 2009.
Klassix Enam
Merupakan acara Pensi (Pentas Seni) yang dibentuk dengan berbagai macam tema. Klassix bertujuan untuk mengapresiasikan kreativitas murid SMA Negeri 6 Jakarta. Diadakan terakhir kali pada 2006.
Mahakam Festival (MaFest)
Acara gabungan dari Mahcup dan Klassix. Diadakan pertama kali pada tahun 2011. MaFest 2011 memiliki tema "Finding Neverland" yang berlangsung antara 26 November - 3 Desember2011. Acara pembukaan dan penutupan diadakan di lapangan gedung SMA Negeri 6 Jakarta, sementara beragam pertandingan olahraga (di antaranya Jujitsu, Futsal, dan Basket) diadakan di GOR Bulungan.:
Pada Tahun 2015 Mahakam Festival diadakan kembali dengan tema "Land Of Reverie" dan berlangsung dari tanggal 10 - 17 Januari 2015. Pada penutupannya (KLASSIX) tanggal 17 Januari bertempat di Tennis Indoor Senayan mengundang beberapa artis ibu kota,seperti Payung Teduh,Gugun Blues Shelter,Princess Joanna dan Sheila On 7.
Pada tanggal 24 September 2012, tepatnya 5 hari setelah Pemilukada DKI Jakarta 2012 tahap kedua, terjadi tawuran pelajar antara siswa SMAN 6 dengan SMAN 70 Jakarta di kawasan Bulungan, Jakarta Selatan. Akibat dari peristiwa tersebut, satu orang siswa tewas terkena bacokan senjata tajam. Petugas Polres Metro Jakarta Selatan menyelidiki kasus tawuran antarsiswa yang kerap terjadi di kawasan Blok M tersebut, termasuk memeriksa beberapa saksi mata yang melihat peristiwa di lokasi kejadian.[1]
