Scuderia Ferrari
Namun rupanya Schumi berpikiran lain. Saat ia masuk ke Ferrari, akhirnya ia sedikit demi sedikit membujuk Byrne agar membatalkan pensiunnya dan lebih baik bekerja di Ferrari. Perlu waktu satu tahun untuk bisa meyakinkan Byrne hingga akhirnya ia bergabung di Ferrari pada 1997.
Di Ferrari, Byrne bersama mantan rekannya di Benetton dulu, Ross Brawn menjadi pahlawan kemenangan Ferrari saat mengantarkan Michael Schumacher menjadi juara dunia tahun 2000 hingga 2004.
Musim 2005 ia mengundurkan diri dari jabatannya sebagai chief designer Ferrari dan menyerahkan kursinya kepada Aldo Costa. Dan mungkin karena itulah Ferrari gagal di dua musim (2005 dan 2006). Ia lantas memilih untuk sabbatical bersama keluarganya di Thailand.
Awal 2007 ia kembali ke Ferrari sebagai konsultan teknik. Hasilnya terlihat jelas saat Kimi Räikkönen akhirnya mampu menjadi juara dunia musim 2007.