Pesantren Mahasiswa Thaybah didirikan untuk mendidik dan membina mahasiswa dan mahasiswi di Kota Surabaya dan sekitarnya. Bangunan masjid Thaybah dan juga asrama santri putra dibangun sekitar tahun 2003 dan diresmikan pada tanggal 21 Maret2004. Adapun wisma santri putri yang berada di dekat kampus UNAIR adalah wakaf dari salah seorang muhsinin.
Kegiatan
Kebanyakan kegiatan pesma Thaybah dilaksanakan setelah subuh atau malam hari. Hal ini dimaksudkan agar tidak mengganggu kegiatan kuliah mahasiswa di kampusnya masing-masing. Di antarakegiatan rutinnya adalah kajian habis subuh sampai sekitar jam 6 pagi. Materi kajian subuh bervariasi tiap hari mulai dari kajian Aqidah, Fikih, Tafsir dan lainnya. Selain kajian rutin adalah juga program tahsin, hafalan al Qur'an dan bahasa Arab.
Pesma Thaybah juga rutin mengadakan Kajian Umum, bakti sosial, pembinaan TPA untuk masyarakat sekitar (di masjid Thaybah), kegiatan Ramadhan dan lainya.
