Pagubugan Kulon adalah sebuah desa di Kecamatan Binangun, Kabupaten Cilacap, Provinsi Jawa Tengah, Indonesia. Desa ini berjarak 6 Km dari ibu kota kecamatan dan 37 Km dari ibu kota Cilacap. Desa Pagubugan Kulon terbagi 3 wilayah Dusun, 8 Rukun Warga (RW), 30 Rukun Tetangga (RT). 3 Dusun yaitu: Dusun Sidamangu, Dusun Telaga, Dusun Tanjung. Masyarakat Desa Pagubugan Kulon mayoritas bermata pencaharian sebagai petani, pekebun, nelayan dan Pengrajin Gula Merah atau Penyadap Nira Kelapa (Penderes).