Klub ini sebelumnya bernama PSKK dan resmi berganti nama menjadi Persekota Koepang pada tahun 2023.[3] Selain mengganti nama, mereka juga mengganti julukannya dari Laskar Abu Nae menjadi Laskar Sonbai. Menurut pengurus Persekota, Wilson Liyanto, nama baru tersebut mengacu pada asal nama Kupang yang berasal dari nama raja Koen Pan yang disebut oleh Belanda sebagai Koepan.
Supporter
Supporter Persekota Koepang bernama CAPITAL BOYS disingkat C.A.B.S.
Skuad
Per 5 November 2025.
Catatan: Bendera menunjukkan tim nasional sesuai dengan peraturan kelayakan FIFA. Pemain bisa saja memiliki lebih dari satu kewarganegaraan non-FIFA.