National Soccer League 2003–2004 adalah edisi ke-28 dari penyelenggaraan National Soccer League, turnamen liga sepak bola tertinggi di Australia. Perth Glory merupakan juara bertahan setelah menjadi juara pada edisi sebelumnya. Pada kompetisi reguler, Perth Glory menjadi pemuncak klasemen, sekaligus menjadi juara musim ini setelah mengalahkan Parramatta Power pada pertandingan final dengan skor 1–0 setelah perpanjangan waktu.
