Pada 2003, NIH mewakili 28%—sekitar US$26,4 miliar—dari total pendanaan riset biomedis per tahunnya di A.S., dengan sisanya berasal dari industri kesehatan.[2]
Riset NIH terbagi menjadi dua bagian: bagian "Extramural" bertugas mendanai riset biomedis di luar NIH, sementara "Intramural" terlibat aktif dalam penelitian. Penelitian intramural sering dilakukan di kampus utamanya di Bethesda, Maryland dan permukiman sekitarnya. Institut Penuaan Nasional dan NInstitut Penyalahgunaan Obat Nasional berada di Baltimore, Maryland, serta National Institut Ilmu Kesehatan Lingkungan Nasional berada di The Triangle, North Carolina. Institut Alergi dan Penyakit Menular Nasional (NIAID) mengelola Laboratorium Rocky Mountain di Hamilton, Montana,[3] yang lebih mengutamakan virologi.