Ada sejumlah jalur air yang penting di Moissac: Sungai Tarn mengalir melalui pusa kota, begitupun Canal de Garonne (dahulu Canal latéral à la Garonne),perpanjangan Canal du Midi dari Toulouse ke Bordeaux. Kedua terusan itu kadang-kadang dikenal dengan nama (harf. kanal dua laut) menghubungkan Samudera Atlantik ke Laut Tengah.