Mohamed Koné mengawali karier seniornya bersama klub Prancis Le Havre B pada tahun 2020. Sejak tahun 2021, ia menjadi bagian dari klub Prancis Le Havre. Pada tahun 2024, ia dipinjamkan ke klub Prancis Dunkerque. Sejak tahun 2024, ia bermain untuk klub Belgia Charleroi.