Maskapai penerbangan ini didirikan dengan nama Alisarda pada 29 Maret1963 oleh Aga Khan sebagai operator taksi udara dan penerbangan charter untuk mempromosikan pariwisata ke Sardinia. Penerbangan terjadwal dimulai pada 1964 dari Olbia. Pada 1989, 35% sahamnya diberikan kepada pemegang saham baru untuk memperkuat perusahaan tersebut dan nama Meridiana diambil pada tanggal 3 Mei1991. Penerbangan internasional pertama dioperasikan pada 1991 menuju Barcelona, Paris, London dan Frankfurt. Saham sebesar 29.95% di Eurofly diperoleh pada Desember 2006. Saham Meridiana sendiri dimiliki oleh Interprogramme (57.19%), SA AgaKhan (17.59%), karyawan (16.08%), Airfin (dalam pencairan) (4.51%), Fondazione Cariplo (3.39%) dan pemegang saham lainnya (1.24%). Karyawannya berjumlah 1,358 orang (Maret 2007).[1]
Maskapai ini mengangkut 3 juta penumpang per tahunnya. Selama 2004, meridiana mengganti 4 pesawat BAe 146-200nya dengan 4 pesawat sewaan Airbus A319-100, dan memiliki rencana untuk pesawat kelima. Pada Januari 2004, dilaporkan bahwa Meridiana merencanakan penggantian armada McDonnell Douglas MD-82nya dengan 17 Airbus A320-200. Pada Desember 2004, dilaporkan bahwa Meridiana memenangkan tender untuk semua rute obligasi penerbangan publik dari dan menuju Sardinia. Bagaimanapun, di bulan tersebut, sebuah pengadilan Italia mencabut kontrak obligasi penerbangan publik tersebut dengan Meridiana hingga pemberitahuan lebih lanjut. [butuh rujukan]