Kecamatan Marabahan pemekaran dari Kecamatan Bakumpai menurut dasar hukumnya Peraturan Pemerintah RI no.28 th 1995.[butuh rujukan]
Pada abad ke-15, kecamatan ini merupakan bandar perdagangan Kerajaan Negara Daha yang disebut Bandar Muara Bahan, karena terletak strategis pada jalur pelayaran kuno di persimpangan tiga sungai yaitu Sungai Banjar (Barito hilir), Sungai Dusun (Barito hulu) dan Sungai Bahan (sungai Negara).[3]
↑Ahyat, Ita (2012). Kesultanan Banjarmasin Pada Abad ke-19. Tangerang Selatan: Serat Alam Media. hlm.17. ISBN978-602-19552-1-5. Pemeliharaan CS1: Status URL (link)