Malaikat Kecil dari India mengisahkan perjuangan hidup tiga anak kecil di Jakarta yang ingin bebas dari tekanan keluarga ayah mereka. Sadia adalah sosok ibu yang harus mengurus tiga anaknya sendiri, Zeeshan, Khanna , dan Zara. Suaminya, Saif, telah meninggal. Sebenarnya, pernikahan Saif dan Sadia tidak disetujui oleh keluarga besar Saif.
Zeeshan harus bekerja membantu ibunya menjual buah-buahan untuk menghidupi keluarga, apalagi dengan kondisi Zara yang tengah sakit. Satu-satunya harapan adalah dari adik Sadia, yaitu Faahad. Faahad menawarkan Sadia untuk berinvestasi di Jakarta dengan membuka restoran India. Namun, Faahad harus menjaga dan menghidupi ketiga keponakannya karena visa Sadia ditahan sehingga ia tidak bisa pergi ke Jakarta.
Faahad bertemu dengan Aaliya yang ternyata datang ke Mumbai untuk mencari kakaknya, Saif, yang telah belasan tahun meninggalkan rumah. Faahad menolong Aaliya yang akan dirampok sehingga mereka bisa berkenalan sampai menjalin hubungan dekat.