Pada babak ini, 8 tim yang berhak melaju dari Babak Kedua dibagi ke dalam 2 grup secara acak, yang terdiri dari 4 tim di setiap grup, untuk bermain satu sama lain dua kali. Pertandingan dimainkan di negara yang bertindak sebagai tuan rumah dalam setiap pertandingan. Pemenang masing–masing grup mendapatkan tiket langsung ke putaran final di Jerman, sementara peringkat ketiga setiap grup akan bermain satu sama lain kandang–tandang dalam suatu pertandingan play-off, dan pemenangnya akan mewakili AFC dalam pertandingan play-off melawan wakil dari CONCACAF untuk selanjutnya melaju ke putaran final.
12Pada awalnya, pertandingan ini direncanakan digelar di Korea Utara, tetapi pada 29 April2005, Komite Disiplin FIFA memutuskan untuk melaksanakan pertandingan ini di stadion netral di negara netral, tanpa penonton, karena gangguan penonton pada dua pertandingan sebelumnya pada 25 dan 30 Maret.[1]
