Di Kabinet Mahathir VII, Kementerian Sains, Teknologi, dan Inovasi bersama nomenklatur lainnya melebur menjadi Kementerian Energi, Sains, Teknologi, Lingkungan Hidup, dan Perubahan Iklim. Namun, setelah Muhyiddin Yassin berkuasa, kementerian dipecah menjadi empat kementerian, yaitu Kementerian Sains, Teknologi, dan Inovasi; Kementerian Energi dan Sumber Daya Alam; Kementerian Lingkungan Hidup dan Air; dan Kementerian Koordinaotr Bidang Program Imunisasi Nasional Covid-19. Nama kementerian ini tetap dipertahankan di pemerintahan Ismail Sabri Yaakob dan Anwar Ibrahim.
Nomenklatur sebelumnya
Kementerian Teknologi, Penelitian, dan Pemerintahan Daerah (1973)
Kementerian Sains, Teknologi, dan Lingkungan Hidup (1976)
Kementerian Sains, Teknologi, dan Inovasi (2004)
Kementerian Energi, Sains, Teknologi, Lingkungan Hidup, dan Perubahan Iklim (2018–2020)
Kementerian Sains, Teknologi, dan Inovasi (2020–sekarang)
