Pada awalnya Kalirejo memilii 2 kelurahan, yaitu Siguk dan Kalipasir, dalam perkembangannya menjadi 1 kelurahan dengan 4 RW.
RW 1 diberikan nama yaitu Kalipasir yang berarti banyak pasir yang terdapat pada kali di RW tersebut.
RW 2 diberikan nama yaitu Kalianyar yang berarti tidak terdapat kali.
RW 3 diberikan nama yaitu Sarowo yang berarti dahulu di RW tersebut ada Rowo.
RW 4 diberikan nama yaitu Rekesan yang berarti dulunya terdapat banyak sawah.
Dan nama kelurahan menjdai kelurahan Kalirejo ialah karena di Kelurahan ini terdapat banyak kali yang sangat menguntungkan masyarakat sehingga masuarakat setempat tidak pernah kekurangan air. Dan masyarakat sangat beruntung mempunyai banyak kali. Kelurahan Kalirejo ditetapkan namanya kira-kira tahun 1852.
Mata Air
Terdapat beberapa mata air di Kelurahan Kalirejo yaitu:
Mata Air Tuk Mudal di Lingkungan Kalipasir RT.4/RW.1.
Mata Air Sendang Waru di Lingkungan Kalianyar RT.2/RW.2.
Mata Air Sendang Kawit di Lingkungan Sarowo RT.4/RW.3.
Mata Air Sendang Legok di Lingkungan Rakesan RT.4/RW.4.
