Place in Khatulistiwa Tengah, 23x15px|border |alt=|link= Sudan Selatan{{SHORTDESC:Place in Khatulistiwa Tengah, 23x15px|border |alt=|link= Sudan Selatan|noreplace}}
Juba memiliki iklim basah dan kering tropis (Köppen: Aw),[3] dan karena Juba terletak dekat dengan khatulistiwa, suhunya panas sepanjang tahun. Namun demikian, hanya sedikit curah hujan dari November sampai Maret, yang juga merupakan waktu dalam setahun dengan suhu maksimum terpanas, mencapai 38°C (100°F) pada bulan Februari. Dari April sampai Oktober, curah hujan lebih dari 100 milimeter (3,9in) per bulan. Total presipitasi dalam setahun mendekati 1.000mm (39in).