José María de Jesús Portugal y Serratos tergabung dalam ordo Fransiskan dan menerima penahbisan imamat pada 16 Juni 1861.
Pada 1 Oktober 1888, Paus Leo XIII mengangkatnya menjadi Uskup Sinaloa. Ia menerima penahbisan episkopal dari Uskup AgungGuadalajara, Pedro José de Jesús Loza y Pardavé, pada 8 Desember. Ia mulai menjabat pada 16 Februari 1889. Pada 28 November 1898, Paus Leo XIII mengangkatnya menjadi Uskup Saltillo. Pada 4 April 1899, ia mulai menjabat. José María de Jesús Portugal y Serratos diangkat pada 30 Mei 1902 menjadi Uskup Aguascalientes. Pada 29 Juli, ia mulai menjabat.