João Nílton dos Santos Souza menerima penahbisan imamat pada 20 Desember 1969. Pada 4 Agustus 1986, Paus Yohanes Paulus II mengangkatnya menjadi uskup koajutorBom Jesus da Lapa. Ia menerima penahbisan episkopal dari Uskup Amargosa, Alair Vilar Fernandes de Melo, pada 9 November didampingi oleh Uskup Emeritus Amargosa, Floréncio Cicinho Vieira, dan Uskup Bom Jesus da Lapa, José Nicomedes Grossi. Pada 31 Agustus 1988, Paus Yohanes Paulus II mengangkatnya menjadi Uskup Amargosa. Ia mulai menjabat pada 30 Oktober. Paus Fransiskus menerima pengunduran dirinya pada 10 Juni 2015.[1]