Luas wilayah Desa Japurakidul mencapai 237.909 hektar yang terbagi menjadi 5 wilayah dusun, yaitu:
Dusun Manis
Dusun Pahing
Dusun Cantilan Lor
Dusun Cantilan Kidul
Batas wilayah Desa Japurakidul adalah:
Utara: Desa Japuralor
Selatan: Desa Japurabakti
Barat: Desa Astanajapura dan Desa Mertapada Wetan
Timur: Desa Beringin
Topografi
Pada umumnya wilayah Desa Japurakidul memiliki tingkat kelerengan antara 35%, di mana topografi datar berada di wilayah permukiman penduduk dan sebagian kecil landai dan curam yang terdapat disekitar bantaran Sungai Singaraja dan Sungai Bangka Deres/Sungai Cimanis. Sedangkan berdasarkan ketinggian dari permukaan laut (dpl), Desa Japurakidul berada di ketinggian antara 3.000cm dpl.
Klimatologi
Seperti halnya dengan daerah lain yang terdapat di Jawa Barat, Wilayah Desa Japurakidul juga beriklim trofis yang ditandai dengan dua musim, yaitu musim panas dan musim penghujan. Musim penghujan berlangsung antara bulan Mei - September, dengan tingkat curah hujan rata-rata berkisar 1000 hingga 2000mm/tahun dengan hari hujan sebanyak 100 – 200 hari/tahun. Sedangkan musim panas atau kemarau berlangsung antara bulan November - April. Suhu udara di Desa Japurakidul pada pagi hari berkisar antara 18 - 23 C, sedangkan pada siang hari suhu udara berkisar antara 27 - 35 C, dengan kelembapan udara rata-rata 80%.