Indeks ini agak mirip dengan International Plant Names Index (IPNI), yang juga melibatkan Royal Botanic Gardens. Bedanya, IPNI tidak menunjukkan nama yang benar, sedangkan Index Fungorum menunjukkan status nama. Pada hasil dari halaman pencarian, nama yang saat ini benar ditunjukkan dengan warna hijau, sementara yang lain berwarna biru (beberapa penggunaan nama yang menyimpang ditunjukkan dengan warna merah). Semua nama ditautkan ke halaman yang memberikan nama yang benar, dengan daftar sinonim.
Nama saat ini dalam Index Fungorum (Species Fungorum)
Tujuan utama dari Index Fungorum adalah untuk menjadi indeks global dari semua nama-nama fungi yang pernah didefinisikan secara valid, tetapi banyak di antaranya yang bertentangan atau tidak lagi digunakan. Species Fungorum adalah sebuah proyek terkait yang berbasis di Royal Botanical Gardens, Kew yang didukung oleh CABI untuk menentukan bagian yang sesuai dengan nama-nama dalam Index Fungorum yang dapat direkomendasikan sebagai nama yang berlaku saat ini. Pencarian dapat dilakukan di daftar Index Fungorum atau Species Fungorum secara terpisah dan hasil Index Fungorum juga memberikan rujukan silang ke Species Fungorum di mana entri tersebut tersedia - nama-nama yang tidak memiliki rujukan tersebut pada umumnya hanya untuk kepentingan sejarah dan tidak dapat diandalkan untuk penggunaan saat ini.[2][3]
Index Fungorum menyediakan layanan web protokol SOAP untuk mencari basis data dan mengambil catatan. Berkas WSDL yang mendeskripsikan layanan tersedia.[4]