Di 525,5 meter (1.724ft) di atas permukaan laut, Gunung Omoto adalah gunung tertinggi di Prefektur Okinawa. Gunung ini terletak di pulau Ishigaki, dekat pusat Pegunungan Omoto, yang membentang dari timur ke barat di sepanjang pesisir utara pulau.
Secara geologis, gunung ini terbentuk dari granit dari Zaman Neogen. Sungai Miyara yang mengalir dari sisi timur laut gunung merupakan sumber air minum dan pertanian penting di pulau tersebut.