Guntoro bergabung ke Tentara Nasional Indonesia Angkatan Darat setelah mengikuti pendidikan di Sepamilsuk ABRI pada tahun 1992 dan menjadi sebagai perwira Korps Kesehatan Militer. Sejumlah posisi pernah diemban olehnya, diantaranya pernah menjabat sebagai Staf Medis Fungsional (SMF) pada Sub Bedah Plastik Departemen Bedah RSPAD Gatot Soebroto pada tahun 2006 dan pernah sebagai Staf Medis Fungsional (SMF) pada Sub Bedah Syaraf di departemen yang sama. Kemudian pada tahun 2020, ia menjabat sebagai Kepala Departemen Bedah RSPAD Gatot Soebroto hingga 25 Maret 2022 sebelum ia dipromosikan menjadi Wakil Kepala Pusat Kesehatan Tentara Nasional Indonesia.
Pada 28 September 2022, ia dipromosikan menjadi Kepala Pusat Kesehatan Tentara Nasional Indonesia dan jabatan itu diemban hingga 26 Oktober 2023 sebelum ia memasuki masa pensiun.[4]
Karier sipil
Selain berkarier sebagai dokter militer, ia berkarier di sejumlah instansi sipil diantaranya sebagai dosen pada program studi spesialis Bedah Plastik Rekontruksi dan Estetik di Fakultas Kedokteran Universitas Syiah Kuala.[5] Ia juga berkarier sebagai dokter spesialis bedah plastik di Siloam Hospitals Kebon Jeruk.[3]