Dengan letak yang strategis di antara sungai Scheldt dan Laut Utara, Vlissingen telah menjadi pelabuhan yang penting selama berabad-abad. Pada abad ke-17, Vlissingen adalah pelabuhan utama kapal Vereenigde Oostindische Compagnie (VOC). Kota ini juga dikenal sebagai tempat kelahiran LaksamanaMichiel de Ruyter.