PSIS Semarang

Musim 2012, Fauzan bergabung bersama PSIS Semarang. Di musim 2014, Fauzan ber-reuni dengan beberapa rekannya di tim Sepak bola Jawa Tengah untuk PON XVIII. Diantaranya, Hari Nur Yulianto, Saptono, Vidi Hasiholan, Eli Nasokha, dan Ivo Andre Wibowo. Sejak musim 2014 Fauzan Fajri dipercaya menjadi Kapten Tim PSIS Semarang. Fauzan Fajri menghabiskan 5 musim bersama PSIS Semarang sejak bergabung bersama PSIS Semarang tahun 2012. Fauzan terpinggirkan dari skuat PSIS di Indonesia Soccer Championship B 2016 karena cedera lutut yang dia derita selama satu tahun lebih.

Persibangga dan Kalteng Putra

Lama tak terdengar kabarnya, menghadapi musim 2017, Fauzan Fajri sempat dikabarkan merapat ke markas Sragen United.^[3] Namun ternyata Fauzan "mudik" ke kampung halamannya Purbalingga untuk bermain di Persibangga Purbalingga. Namun sayang Persibangga Purbalingga hanya mampu menjadi juru kunci Grup 3 Liga 2 2017 membuat klub asal Purbalingga ini dipastikan terdegradasi.^[4] Dipertengahan musim pun Fauzan emilih hengkang ke Kalteng Putra FC^[5] yang langkahnya terhenti di babak 8 besar Liga 2 2017.

PSIS Semarang

08 Januari 2018, Fauzan kembali ke PSIS Semarang setelah mengikuti trial selama 1 minggu,^[6] kemudian di kontrak untuk 2 musim kompetisi, Sayangnya Fauzan mengalami cedera yang membuatnya harus absen di separuh kompetisi setelah menjalani operasi lututnya.

.Mitra Kukar

Sembuh dari cedera lututnya di awal musim kompetisi Liga 1 Tahun 2020, Fauzan di pinjamkan ke Klub Liga 2 Mitra Kukar, dia bereuni dengan mantan pelatihnya di PSIS Jafri Sastra.