Dalam perjalanan kariernya, Edy Murbowo pernah menjabat sebagai Kepala Subbagian Penerimaan Bagian Pengendalian Personel Biro Pengendalian Personel Staf Sumber Daya Manusia Polri. Pada tahun 2009, ia diangkat menjadi Kepala Kepolisian Resort Pekalongan. Pada tahun 2011, ia diangkat menjadi Kepala Kepolisian Resort Magelang.[3] Ia dipercaya sebagai Kepala Bagian Pembinaan Jasmani Biro Perawatan Personel Staf Sumber Daya Manusia Polri. Pada tahun 2013, ia menjadi Kepala Biro Sumber Daya Manusia Kepolisian Daerah Kalimantan Selatan[4], dan tahun 2014 menjadi Perwira Menengah dalam rangka mengikuti pendidikan di Sekolah Staf dan Pimpinan.
Pada tahun 2016, ia dipercaya sebagai Kepala Biro Sumber Daya Manusia Kepolisian Daerah Jawa Tengah. Pada tahun 2017, ia menjadi Kepala Bagian Perencanaan Biro Kebijakan dan Strategi Staf Sumber Daya Manusia Polri.[5] Pada tahun 2020, ia bertugas sebagai Direktur Pembinaan Potensi Masyarakat Korps Pembinaan Masyarakat Badan Pemelihara Keamanan Kepolisian Negara Republik Indonesia.
Selanjutnya, pada tahun 2024, Edy Murbowo menjabat sebagai Kepala Korps Pembinaan Masyarakat Badan Pemelihara Keamanan Kepolisian Negara Republik Indonesia dan pada tahun 2025 menjabat sebagai Kepala Kepolisian Daerah Nusa Tenggara Barat.