Pada tahun 2018, Muñoz berpartisipasi dalam European Talent Cup, di mana dalam dua musim ia memperoleh tiga podium termasuk kemenangan di MotorLand Aragón. Pada tahun 2020, ia mengikuti Red Bull MotoGP Rookies Cup, musim pertamanya berakhir dengan tiga kali finis podium dan tahun berikutnya, tujuh kali lagi ditambahkan, termasuk dua kemenangan.[1] Hasil-hasil ini di tahun keduanya membawanya finis ketiga di klasemen pembalap. Di tahun yang sama, ia ikut serta dalam Kejuaraan Dunia FIM JuniorGP, di mana ia memenangkan dua balapan lagi, yang pertama di Aragón dan yang kedua di Jerez.[2]
Moto3
2022
Pada 2022, Muñoz melakoni debutnya di kejuaraan dunia balap untuk tim Boé Motorsports di Moto3. Karena masih terlalu muda, Muñoz terpaksa absen dari tujuh balapan pertama musim ini karena peraturan dan ia melakoni debutnya di Grand Prix Italia.[3][4] Di Grand Prix Catalan, yang kedua diadakan untuk pembalap Spanyol, ia meraih podium pertamanya di kejuaraan dunia, finis di posisi kedua di belakang Izan Guevara.[5] Pada musim tersebut ia kembali naik podium dan finis di posisi ketiga di Grand Prix Austria.