Pada 21 Januari 2006, Paus Benediktus XVI mengangkatnya menjadi Nunsius Apostolik untuk Israel dan Siprus serta Delegasi Apostolik untuk Yerusalem dan Palestina.[7] Pada April 2007, Franco mengancam untuk memboikot acara peringatan Holokaus di Yad Vashem dengan alasan museum tersebut menyebut perilaku Paus Pius XII terhadap Yahudi pada Perang Dunia II. Franco akhirnya mengalah dan berkata bahwa ia hanya ingin menarik perhatian terhadap pertanyaan tersebut dan menyebut sengketa tersebut "hanyalah diplomasi".[8] Plakat museum tersebut yang menyebut kegiatan Paus Pius kemudian dimodifikasi.[9] Franco juga membantu mengurusi kunjungan Paus Benediktus ke Tanah Suci pada Mei 2008, dan ia memajukan diskusi antar komunitas agama dan Takhta Suci dan pemerintah kawasan tersebut.[9]
Franco pensiun dari penugasan diplomatik pada Agustus 2012 namun masih bertugas untuk menangani negosiasi antar Takhta Suci dan Israel terkait masalah fiskal, pajak dan lahan Gereja di Israel.[9]
↑www.gubbernet.com, Gubbernet s.r.l. - Soluzioni per internet avvincente -. "30Giorni". www.30giorni.it (dalam bahasa Italia). Diakses tanggal 17 May 2017.
