* Penampilan dan gol di klub senior hanya dihitung dari liga domestik dan akurat per 25 Mei 2025 ‡ Penampilan dan gol di tim nasional akurat per 9 Juni 2025
Pada Oktober 2017, Saelemaekers menandatangani kontrak dengan Anderlecht hingga 2019. Pada 16 Februari 2018, dia membuat debut resminya saat menghadapi Sint-Truiden. Dia masuk sebagai pemain pengganti pada menit ke-77. Pada 8 Juni 2018, dia memperbarui kontraknya hingga 2022.
Dipinjamkan ke AC Milan
Pada 31 Januari 2020, AC Milan mendatangkan Saelemaekers sebagai pemain pinjaman, dengan opsi pembelian.[3][4] Dia membuat debut resminya saat menggantikan Davide Calabria dalam hasil imbang 1–1 menghadapi Verona pada 2 Februari 2020.[5]
AC Milan
Pada 1 Juli 2020, Saelemaekers menandatangani kontrak permanen bersama AC Milan hingga 30 Juni 2024.[6] Pada 18 Juli, dia mencetak gol pertamanya untuk Milan dalam kemenangan 5–1 atas Bologna dalam pertandingan Serie A.[7]
Pada Oktober 2021, Saelemaekers memperpanjang kontraknya bersama AC Milan hingga musim panas 2026.[8]
Dipinjamkan ke Bologna
Pada 31 Agustus 2023, Bologna resmi mengumumkan perekrutan Alexis Saelemaekers dari AC Milan.[8] Dia diboyong dengan status pinjaman, tapi terdapat opsi pembelian pada musim depan. Rossoblu membayar biaya sekitar €500 ribu untuk meminjam Saelemaekers. Kemudian, harga untuk mempermanenkannya mencapai €10 juta.[8]
Pada 21 September, dia membuat debut saat menggantikan Dan Ndoye pada menit ke-65 dalam hasil imbang 0–0 melawan Napoli.[9]
↑"Comunicato Ufficiale N. 267"[Official Communication No. 267](PDF) (dalam bahasa Italia). Lega Serie A. 19 Juli 2020. hlm.3. Diarsipkan dari asli(PDF) tanggal 20 Juli 2020. Diakses tanggal 15 November 2022.