Ajax Zaterdag didirikan pada tahun 1983 atas saran dari Johan Cruijff. Dia membayangkan Ajax Zaterdag sebagai “Jong Ajax kedua”, tempat bagi para pemain akademi yang berkembang lebih lambat untuk terus diasah dan menguatkan mental mereka.[4]
Tim utama Ajax Zaterdag sempat bermain di level amatir tertinggi pada musim 1993–94, 1995–96, serta dari 2003–04 hingga 2008–09 (sebagai tim Hoofdklasse). Pada musim 2014–15, tim ini kembali tampil di level tersebut, kali ini sebagai tim Topklasse. Namun, masa itu hanya bertahan satu musim karena mereka gagal menghindari degradasi kembali ke Hoofdklasse.
Pada 16 Juni 2018, tim ini memastikan promosi ke Derde Divisie melalui babak play-off setelah menang 2–1 atas VV Capelle, yang menyebabkan lawannya terdegradasi ke Hoofdklasse.[5]
Pada tahun 2022, Ajax kembali terdegradasi ke divisi keempat, Vierde Divisie.
Setelah dua musim berkompetisi di Vierde Divisie, Ajax berhasil meraih promosi spektakuler kembali ke Derde Divisie pada tahun 2024. Di babak terakhir, Ajax menghadapi SV Huizen, yang unggul dua poin di klasemen. Ajax memenangkan pertandingan tersebut 2–1 lewat gol di masa tambahan waktu.
