* Penampilan dan gol di klub senior hanya dihitung dari liga domestik dan akurat per 05:07, 14 April 2025 (UTC) ‡ Penampilan dan gol di tim nasional akurat per 23:37, 25 Maret 2025 (UTC)
Pada 7 Oktober 2018, Éderson dipanggil untuk bermain bagi timnas U-20 Brasil dalam dua pertandingan persahabatan melawan Cile pada 13 dan 15 Oktober 2018.[1][2] Ia bermain sebagai pemain inti dalam pertandingan kedua, yang berakhir imbang 2-2.[3]
Pada 19 Mei 2024, Éderson menerima panggilan pertamanya ke tim senior Brasil, dimasukkan dalam skuad untuk Copa América 2024.[4] Ia melakoni debutnya pada 8 Juni 2024 dalam pertandingan persahabatan melawan Meksiko di Kyle Field di Texas, Amerika Serikat. Ia menjadi pemain inti dan bermain selama 84 menit, Brasil menang 3-2.[5]